Novi omikron soj koronavirusa otkriven je u Južnoj Africi. Naučnici u Južnoj Africi istakli su ga kao potencijalno zabrinjavajuću varijantu. Od tada se proširio na više od deset zemalja, od kojih su mnoge uvele ograničenja putovanja kako bi sprečile širenje virusa.
Kako otkriti omikron soj?
Brisevi nosa i grla iz testova lančane reakcije polimeraze (PCR), koji se šalju u laboratoriju na analizu, otkrivaju da li su ljudi zaraženi koronavirusom. U zavisnosti od toga u koju laboratoriju se brisevi šalju, neki takođe mogu pomoći u identifikaciji određenih varijanti, kao što su delta ili omikron.
Samo neke laboratorije imaju potrebnu tehnologiju da to urade. SAD vode u svetu u PCR testiranju, a slede Velika Britanija, Rusija, Nemačka, Italija i Južna Koreja.
Brisevi iz PCR testova koji su dali pozitivan rezultat za ono što liči na omikron šalju su u laboratoriju na genetsku analizu, gde se koristi tehnika poznata kao genomsko sekvenciranje. Ova laboratorijska analiza genetskog materijala virusa je ključna za otkrivanje sojeva i kako oni deluju.
Mnogi slučajevi infekcije omikronom su neotkriveni jer može potrajati nekoliko nedelja da se ovaj proces završi. Testovi brzog ili bočnog protoka, koji se mogu koristiti kod kuće, ne mogu vam reći kojim sojem ste zaraženi – ali se i dalje smatra da mogu da vam kažu da li ste negativni ili pozitivni.
Poreklo omikron soja
Ovaj soj otkriven je 16. novembra ove godine u Južnoj Africi. Tog dana zabeleženo je 136 slučaja zaraze koronavirusom. Više od 80% ovih slučajeva zabeleženo je u provinciji Gauteng, koja obuhvata glavni grad Pretoriju i najveći grad Johanesburg.
Istraživanja procenjuju da je R-vrednost što označava prsoečan broj novih slučajeva infekcije 1.47 na nivou Južne Afrike, a u oblasti Gauteng on iznosi 1.93. Kada je R-vrednost iznad 1 to znači da se zaraza širi eksponencijalno.
Naučnici u Južnoj Africi veruju da je novi omikron soj odgovoran za ovakav skok zaraženih. Trenutno naučnici imaju tri hipoteze o poreklu omikrona:
- Mutacija kod imunokompromitovane osobe
- Mutacija u telu hroničnog kovid pacijenta
- Mutacija kod životinje zaražene originalnim ljudskim sojem koji je ponovo prešao na čoveka.
Međutim, većina naučnika trenutno teži mišljenju da je omikron mutacija nastala kod imunokompromitovanih ljudi. Ovo stanje omogućava da infekcija dugo ostane u telu, uzrokujući lako akumuliranje mutacija, dok se virus ne razvije u novi soj koji se dosta razlikuje od originalnog.
Simptomi omikron soja
Svetska zdravstvena organizacija kaže da nema informacija koje bi sugerisale da se simptomi omikrona razlikuju od onih kod drugih sojeva – tako da na kašalj, groznicu i gubitak ukusa ili mirisa i dalje treba obratiti pažnju. Potpuno vakcinisani ljudi u Južnoj Africi su zaraženi omikronom, ali su njihovi simptomi blagi.
Omikron soj ima mnogo različitih mutacija koje ranije nisu viđene, ali i mnoge koje jesu. Kod beta soja su tri, kod delta dve, a kod omikrona čak 15.
U standardnim testovima, omikron ima ono što je poznato kao „ispadanje S-gena” što olakšava praćenje pozitivnih slučajeva koji liče na ovaj soj. Ali neće svi slučajevi „ispadalja S-gena” nužno biti omikron – potrebno je potpuno genomsko sekvenciranje da bismo bili sigurni.
Analiza genetskog sastava virusa je ključni deo rada na tome kako je koji soj uključen. Pažljivo posmatrajući dobijeni genetski materijal, naučnici mogu da potvrde da li je neko zaražen omikronom ili deltom koja je već široko rasprostranjena.
Ovaj proces pruža samo informacije o brisevima koji se analiziraju – ali koristeći te rezultate, naučnici su u mogućnosti da procene koliki bi procenat novih slučajeva mogao biti novi soj. Naučnici u Velikoj Britaniji i Južnoj Africi prednjače u ovoj tehnologiji, zbog čega je većina novih sojeva otkrivena u ovim zemljama. Ali to ne znači da su tamo nastali.
Moguće je da je soj omikron, koji prouzrokuje kovid-19, dobio bar jednu od svojih mutacija pokupivši isečak genetskog materijala drugog virusa, verovatno onog koji prouzrokuje prehladu, prisutnog istovremeno u zaraženim ćelijama. Taj genetski kod ne pojavljuje se ni u jednom ranijem soju koronavirusa, nazvanog SARS-CoV-2, ali je sveprisutan u mnogim drugim virusima, uključujući one koji prouzrokuju prehladu, a takođe i u ljudskom genomu.
Isti genetski kod pojavljuje se mnogo puta u jednom od koronavirusa koji prouzrokuje prehladu kod ljudi – poznatom kao HCoV-229E – i u virusu ljudske imunodeficijencije (HIV) koji prouzrokuje AIDS.
Neutrališe antitela
Dr. Ričard Lesel specijalista za infektivne bolesti u Afričkom centru za zdravlje i populacione studije, otkrio je da genom omikron soja ima nekoliko mutacija koje su povezane sa neutralisanjem antitela. Ovo se ne odnosi samo na antitela nastala vakcinacijom ili preležanom infekcijom, već i terapeutska monoklonska antitela.
Takođe otkriva da omikron soj ima čitav niz mutacija koje nalaze efikasan prolaz do ćelija i olakšava prenosivost.
Zašto su naučnici zabrinuti?
Kada se pojavio novi soj Svetska zdravsrvena organizacija označila je B.1.1.529 iliti omikron kao nešto zabrinjavajuće. Tu preporuku u narednih nekoliko dana sledilo je nekoliko zemalja sveta, koje su uvele dodatne restrikcije za putnike iz zemalja sa juga Afrike.
Glavni razlog je mnogo više mutacija za razliku od prethodnih sojeva. Ono što posebno zabrinjava je veoma jaka pretpostavka da se ovaj soj prilično dugo razvija unutar ljudskog imunog sistema, posebno kod onih koji nisu vakcinisani.
A kako i dalje ima dosta područja na svetu sa mnogo nevakcinisanih osoba, to je dovoljan razlog za brigu kod naučnika. Ono što će biti od posebne važnosti ovih dana je:
- Kako će različite vakcine imati dejstvo na ovaj soj
- Kakav će biti njegov uticaj na stopu reinfekcije
- Koliko se širi brzo omikron
- Koja je relativna sposobnost Omikrona u poređenju sa Delta sojem
Omikron soj u regionu
U Hrvatskoj je i zvanično potvrđeno prisustvo novog omikron soja korona virusa, rečeno je na konferenciji za medije održanoj 6. decembra na kojoj je govorio i Krunoslav Capak, direktor Hrvatskog zavoda za javno zdravlje. Kako je objašnjeno osobe kod kojih je otkriven novi soj nisu bile van Hrvatske, ali su bile prisutne na jednom poslovnom skupu, te je moguće da su se tu zarazili.
Oba pacijenta su vakcinisana, a njihovi simptomi podrazumevali su povišenu temperaturu par dana i opštu slabost. Epidemiolog Bernard Kaić rekao je da je zaštita koju pružaju vakcine od težeg obolevanja i dalje velika.
Zaštita od razvoja srednjih do teških simptoma cijepljenjem je i dalje solidna, čak oko 90 posto. I ovo dvoje koji su oboljeli nemaju težak oblik bolesti – rekao je Kaić
